Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pnma5Q5DTT8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnma5Q5DTT8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms