Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chsy3Q5DTK1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms