Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms