Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WhammQ571B6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms