Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms