Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd28Q505D1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms