Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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Usp48Q3V0C5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp48Q3V0C5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp48Q3V0C5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp48Q3V0C5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp48Q3V0C5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp48Q3V0C5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp48Q3V0C5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp48Q3V0C5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp48Q3V0C5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp48Q3V0C5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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