Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms