Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnpc3Q3UZ01 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnpc3Q3UZ01 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms