Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pfdn4Q3UWL8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pfdn4Q3UWL8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pfdn4Q3UWL8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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