Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms