Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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