Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms