Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpaQ3UU96 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdc42bpaQ3UU96 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdc42bpaQ3UU96 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdc42bpaQ3UU96 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdc42bpaQ3UU96 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdc42bpaQ3UU96 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpaQ3UU96 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms