Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm6899Q3USS0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gm6899Q3USS0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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