Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms