Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mccc2Q3ULD5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms