Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms