Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms