Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK8

Tnrc6a, Trinucleotide repeat-containing gene 6A protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,896 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6aQ3UHK8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnrc6aQ3UHK8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnrc6aQ3UHK8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnrc6aQ3UHK8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnrc6aQ3UHK8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnrc6aQ3UHK8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnrc6aQ3UHK8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnrc6aQ3UHK8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnrc6aQ3UHK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms