Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms