Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH2

Slc22a23, Solute carrier family 22 member 23, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a23Q3UHH2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a23Q3UHH2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a23Q3UHH2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms