Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH99

Shisa6, Protein shisa-6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa6Q3UH99 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa6Q3UH99 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa6Q3UH99 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms