Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms