Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr41Q3UDP0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr41Q3UDP0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms