Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trafd1Q3UDK1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms