Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U6N9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms