Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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