Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms