Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms