Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

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Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm2Q3TWN3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnnm2Q3TWN3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms