Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TchpQ3TVW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms