Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms