Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms