Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms