Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdpd4Q3TT99 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms