Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700066B19RikQ3TS39 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms