Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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