Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms