Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms