Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cwc27Q3TKY6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms