Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms