Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Treml4Q3LRV9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms