Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms