Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo3Q2TJ95 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms