Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms