Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Fam178bQ24JP3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam178bQ24JP3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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