Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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