Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

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Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo3bQ1EG27 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo3bQ1EG27 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms