Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam171bQ14CH0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms